En el año 2005 según datos del último conteo del censo de población y vivienda, existe un total de 49,850 personas de los cuales 24,674 son hombres (49.50%), y 25,176 son mujeres (50.50%). En el año 2000, según el Censo del INEGI, el municipio de Calkiní, tenía 46,899 habitantes, de los cuales 23,203 son hombres que representa el (49.47 %), y 23,696 son mujeres (50.53 %).
Cinco poblaciones concentran el 80% aproximadamente de la población, Calkiní 28.7%, Dzitbalché 22.0%, Bécal 12.9%, Nunkiní 11.1% y Bacabchén 4.7%. Las restantes conjuntan el 20%.
En cuanto a la etnia maya, existen 26,481 personas mayas parlantes en el municipio, lo que representa una población del 57.91%. El 90% de la población es de origen Maya.
Del año 2000 al 2005 la Población total del Municipio creció 6.3% de 46,899 a 49,850 respectivamente; la cabecera, Dzitbalché, Santa Cruz Pueblo, y Sahcabchén crecieron arriba del 8%, mientras que la Junta de Bécal apenas creció un 0.7% y Tankuché decreció un -4.2% respectivamente.
Según datos del COESPO, la población de Calkiní crece a un ritmo de 2.01% media anual, a este ritmo para el año 2028 la población en el Municipio habrá tenido un crecimiento del 100%. Con este panorama poblacional es importante una planeación estratégica para el desarrollo urbano del Municipio de Calkiní. Este crecimiento implica en un futuro mayor demanda de servicios públicos, infraestructura, demanda social básica y productiva. A futuro se visualiza una realidad más compleja, es necesario sentar las bases para la solución de los problemas socioeconómicos en el corto, mediano y largo plazo.
De acuerdo a proyecciones del Consejo Estatal de Población del año 2005 la población urbana es de 36,443 personas y la rural de 13,407 personas, siendo un 72.5 y 27.5 por ciento respectivamente, esta tendencia al parecer no mostrará grandes cambios en el futuro.
Según Datos del Cuaderno Estadístico de Calkiní del INEGI, en el año 2006 hubo 1,132.0 nacimientos en el municipio, de los cuales 542 son hombres y 590 son mujeres. En el año 2005 se registraron 226 fallecimientos generales de los cuales 120 son del sexo masculino y 106 son del sexo femenino.
Es importante resaltar el descenso de la mortalidad en menores de 1 año del 2000 al 2005, en la gráfica de la Tasa de Mortalidad Infantil, podemos observar comparativamente, que en el año 2004 se registraron 14.6 muertes por cada mil niños, pero para el 2005 fueron 5.4 muertos por cada mil. Esto refleja en parte un avance en la atención médica del municipio.
En el 2009 se registraron en el municipio de Calkiní 497 matrimonios; en la disolución del vínculo matrimonial se efectuaron 25 divorcios.
En el municipio existen diversas agrupaciones que practican algún tipo de religión de las siguientes iglesias: La Católica, Nacional Presbiteriana, Bautista, Iglesia de las Asamblea de Dios, Mormona, Adventista del Séptimo Día, La Luz del Mundo y Testigos de Jehová. A pesar de que existe una gran variedad de creencias religiosas sigue predominando la religión católica con el 80%.